Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI0

Znf12, Zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf12Q7TSI0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Znf12Q7TSI0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf12Q7TSI0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms