Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim17Q7TPM3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms