Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sbno2Q7TNB8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms