Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmc8Q7TN58 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms