Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tmed3Q78IS1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmed3Q78IS1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms