Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gja6Q6S5G4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gja6Q6S5G4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.5 ms