Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptx4Q6RUU0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptx4Q6RUU0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms