Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Med16Q6PGF3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med16Q6PGF3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms