Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AtminQ6P9S1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms