Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5W5

SLC39A4, Zinc transporter ZIP4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A4Q6P5W5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC39A4Q6P5W5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC39A4Q6P5W5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC39A4Q6P5W5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC39A4Q6P5W5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC39A4Q6P5W5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC39A4Q6P5W5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC39A4Q6P5W5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC39A4Q6P5W5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC39A4Q6P5W5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC39A4Q6P5W5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms