Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S1

DENND1B, DENN domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND1BQ6P3S1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DENND1BQ6P3S1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.2 ms