Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Szrd1Q6NXN1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms