Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
U2surpQ6NV83 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
U2surpQ6NV83 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
U2surpQ6NV83 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
U2surpQ6NV83 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
U2surpQ6NV83 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
U2surpQ6NV83 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2surpQ6NV83 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2surpQ6NV83 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2surpQ6NV83 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2surpQ6NV83 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
U2surpQ6NV83 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
U2surpQ6NV83 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
U2surpQ6NV83 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
U2surpQ6NV83 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
U2surpQ6NV83 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
U2surpQ6NV83 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
U2surpQ6NV83 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
U2surpQ6NV83 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
U2surpQ6NV83 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
U2surpQ6NV83 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
U2surpQ6NV83 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
U2surpQ6NV83 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
U2surpQ6NV83 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
U2surpQ6NV83 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
U2surpQ6NV83 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
U2surpQ6NV83 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
U2surpQ6NV83 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
U2surpQ6NV83 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
U2surpQ6NV83 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 208.6 ms