Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRNIPQ6NTE8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRNIPQ6NTE8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRNIPQ6NTE8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 244.3 ms