Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS82

Retreg2, Reticulophagy regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg2Q6NS82 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retreg2Q6NS82 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms