Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ggnbp1Q6K1E7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.1 ms