Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rftn1Q6A0D4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.6 ms