Protein–RNA interactions for Protein: Q6A026

Pds5a, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5aQ6A026 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pds5aQ6A026 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pds5aQ6A026 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pds5aQ6A026 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pds5aQ6A026 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pds5aQ6A026 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pds5aQ6A026 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pds5aQ6A026 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pds5aQ6A026 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pds5aQ6A026 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pds5aQ6A026 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pds5aQ6A026 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pds5aQ6A026 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pds5aQ6A026 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pds5aQ6A026 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pds5aQ6A026 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pds5aQ6A026 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pds5aQ6A026 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pds5aQ6A026 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pds5aQ6A026 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pds5aQ6A026 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pds5aQ6A026 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pds5aQ6A026 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pds5aQ6A026 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pds5aQ6A026 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms