Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Thsd7aQ69ZU6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Thsd7aQ69ZU6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Thsd7aQ69ZU6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Thsd7aQ69ZU6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Thsd7aQ69ZU6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Thsd7aQ69ZU6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Thsd7aQ69ZU6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Thsd7aQ69ZU6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Thsd7aQ69ZU6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Thsd7aQ69ZU6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Thsd7aQ69ZU6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Thsd7aQ69ZU6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Thsd7aQ69ZU6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Thsd7aQ69ZU6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Thsd7aQ69ZU6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Thsd7aQ69ZU6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Thsd7aQ69ZU6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Thsd7aQ69ZU6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Thsd7aQ69ZU6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Thsd7aQ69ZU6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Thsd7aQ69ZU6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Thsd7aQ69ZU6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Thsd7aQ69ZU6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Thsd7aQ69ZU6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Thsd7aQ69ZU6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Thsd7aQ69ZU6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Thsd7aQ69ZU6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Thsd7aQ69ZU6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Thsd7aQ69ZU6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Thsd7aQ69ZU6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Thsd7aQ69ZU6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Thsd7aQ69ZU6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Thsd7aQ69ZU6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.5 ms