Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atg9aQ68FE2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atg9aQ68FE2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atg9aQ68FE2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atg9aQ68FE2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atg9aQ68FE2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atg9aQ68FE2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atg9aQ68FE2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atg9aQ68FE2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atg9aQ68FE2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atg9aQ68FE2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atg9aQ68FE2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atg9aQ68FE2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atg9aQ68FE2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atg9aQ68FE2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atg9aQ68FE2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Atg9aQ68FE2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atg9aQ68FE2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atg9aQ68FE2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atg9aQ68FE2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atg9aQ68FE2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atg9aQ68FE2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atg9aQ68FE2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atg9aQ68FE2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atg9aQ68FE2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atg9aQ68FE2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atg9aQ68FE2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atg9aQ68FE2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atg9aQ68FE2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atg9aQ68FE2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atg9aQ68FE2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atg9aQ68FE2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atg9aQ68FE2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
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