Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp4eQ66X19 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp4eQ66X19 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms