Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup62Q63850 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nup62Q63850 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nup62Q63850 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nup62Q63850 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nup62Q63850 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nup62Q63850 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nup62Q63850 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nup62Q63850 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nup62Q63850 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nup62Q63850 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nup62Q63850 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nup62Q63850 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nup62Q63850 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nup62Q63850 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms