Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ndufa4Q62425 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndufa4Q62425 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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