Protein–RNA interactions for Protein: Q62313

Tgoln1, Trans-Golgi network integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgoln1Q62313 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgoln1Q62313 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgoln1Q62313 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgoln1Q62313 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgoln1Q62313 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgoln1Q62313 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgoln1Q62313 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgoln1Q62313 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 362.1 ms