Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd180Q62192 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cd180Q62192 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms