Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttf1Q62187 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Ttf1Q62187 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttf1Q62187 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ttf1Q62187 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Ttf1Q62187 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Ttf1Q62187 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Ttf1Q62187 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ttf1Q62187 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ttf1Q62187 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ttf1Q62187 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Ttf1Q62187 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Ttf1Q62187 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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Ttf1Q62187 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ttf1Q62187 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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Ttf1Q62187 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttf1Q62187 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttf1Q62187 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttf1Q62187 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttf1Q62187 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttf1Q62187 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttf1Q62187 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttf1Q62187 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttf1Q62187 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttf1Q62187 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttf1Q62187 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttf1Q62187 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttf1Q62187 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttf1Q62187 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttf1Q62187 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttf1Q62187 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttf1Q62187 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttf1Q62187 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttf1Q62187 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttf1Q62187 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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