Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema3cQ62181 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema3cQ62181 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms