Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mre11Q61216 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms