Protein–RNA interactions for Protein: Q61194

Pik3c2a, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2aQ61194 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pik3c2aQ61194 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Pik3c2aQ61194 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pik3c2aQ61194 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pik3c2aQ61194 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Pik3c2aQ61194 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pik3c2aQ61194 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pik3c2aQ61194 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pik3c2aQ61194 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pik3c2aQ61194 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Pik3c2aQ61194 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pik3c2aQ61194 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pik3c2aQ61194 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pik3c2aQ61194 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pik3c2aQ61194 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pik3c2aQ61194 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Pik3c2aQ61194 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pik3c2aQ61194 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pik3c2aQ61194 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pik3c2aQ61194 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pik3c2aQ61194 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Pik3c2aQ61194 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pik3c2aQ61194 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pik3c2aQ61194 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pik3c2aQ61194 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pik3c2aQ61194 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pik3c2aQ61194 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pik3c2aQ61194 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pik3c2aQ61194 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pik3c2aQ61194 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Pik3c2aQ61194 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pik3c2aQ61194 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pik3c2aQ61194 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pik3c2aQ61194 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pik3c2aQ61194 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pik3c2aQ61194 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pik3c2aQ61194 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pik3c2aQ61194 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pik3c2aQ61194 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pik3c2aQ61194 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pik3c2aQ61194 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pik3c2aQ61194 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pik3c2aQ61194 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pik3c2aQ61194 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pik3c2aQ61194 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pik3c2aQ61194 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pik3c2aQ61194 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pik3c2aQ61194 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pik3c2aQ61194 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pik3c2aQ61194 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pik3c2aQ61194 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pik3c2aQ61194 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pik3c2aQ61194 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pik3c2aQ61194 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pik3c2aQ61194 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Pik3c2aQ61194 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pik3c2aQ61194 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Pik3c2aQ61194 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pik3c2aQ61194 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pik3c2aQ61194 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pik3c2aQ61194 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pik3c2aQ61194 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Pik3c2aQ61194 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pik3c2aQ61194 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Pik3c2aQ61194 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pik3c2aQ61194 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pik3c2aQ61194 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pik3c2aQ61194 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms