Protein–RNA interactions for Protein: Q61116

Znf235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf235Q61116 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf235Q61116 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf235Q61116 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms