Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NinQ61043 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NinQ61043 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NinQ61043 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NinQ61043 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NinQ61043 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NinQ61043 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NinQ61043 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NinQ61043 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NinQ61043 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NinQ61043 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NinQ61043 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NinQ61043 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NinQ61043 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NinQ61043 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NinQ61043 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NinQ61043 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NinQ61043 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NinQ61043 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NinQ61043 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NinQ61043 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NinQ61043 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NinQ61043 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NinQ61043 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NinQ61043 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NinQ61043 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NinQ61043 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NinQ61043 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NinQ61043 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NinQ61043 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NinQ61043 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NinQ61043 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NinQ61043 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NinQ61043 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NinQ61043 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NinQ61043 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NinQ61043 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NinQ61043 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NinQ61043 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NinQ61043 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NinQ61043 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NinQ61043 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NinQ61043 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NinQ61043 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NinQ61043 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NinQ61043 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NinQ61043 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NinQ61043 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NinQ61043 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NinQ61043 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NinQ61043 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NinQ61043 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NinQ61043 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NinQ61043 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NinQ61043 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NinQ61043 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NinQ61043 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NinQ61043 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NinQ61043 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NinQ61043 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NinQ61043 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NinQ61043 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NinQ61043 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NinQ61043 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NinQ61043 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NinQ61043 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NinQ61043 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NinQ61043 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NinQ61043 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NinQ61043 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NinQ61043 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NinQ61043 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NinQ61043 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NinQ61043 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NinQ61043 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NinQ61043 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NinQ61043 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NinQ61043 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NinQ61043 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NinQ61043 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NinQ61043 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NinQ61043 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NinQ61043 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NinQ61043 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NinQ61043 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NinQ61043 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NinQ61043 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NinQ61043 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NinQ61043 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NinQ61043 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NinQ61043 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NinQ61043 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NinQ61043 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NinQ61043 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NinQ61043 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NinQ61043 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NinQ61043 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NinQ61043 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NinQ61043 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NinQ61043 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms