Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp1r1bQ60829 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp1r1bQ60829 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms