Protein–RNA interactions for Protein: Q60715

P4ha1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha1Q60715 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P4ha1Q60715 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P4ha1Q60715 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P4ha1Q60715 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P4ha1Q60715 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P4ha1Q60715 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P4ha1Q60715 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P4ha1Q60715 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P4ha1Q60715 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P4ha1Q60715 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P4ha1Q60715 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P4ha1Q60715 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P4ha1Q60715 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P4ha1Q60715 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P4ha1Q60715 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
P4ha1Q60715 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P4ha1Q60715 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P4ha1Q60715 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P4ha1Q60715 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P4ha1Q60715 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
P4ha1Q60715 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P4ha1Q60715 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
P4ha1Q60715 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P4ha1Q60715 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
P4ha1Q60715 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P4ha1Q60715 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
P4ha1Q60715 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
P4ha1Q60715 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P4ha1Q60715 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P4ha1Q60715 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P4ha1Q60715 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
P4ha1Q60715 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms