Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm1Q60636 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm1Q60636 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms