Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MLIPQ5VWP3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLIPQ5VWP3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms