Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTQ0

TTC39B, Tetratricopeptide repeat protein 39B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39BQ5VTQ0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC39BQ5VTQ0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TTC39BQ5VTQ0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC39BQ5VTQ0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms