Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU5

Fbxo39, F-box only protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo39Q5NBU5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbxo39Q5NBU5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbxo39Q5NBU5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbxo39Q5NBU5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo39Q5NBU5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo39Q5NBU5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo39Q5NBU5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo39Q5NBU5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo39Q5NBU5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxo39Q5NBU5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxo39Q5NBU5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxo39Q5NBU5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxo39Q5NBU5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo39Q5NBU5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo39Q5NBU5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo39Q5NBU5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo39Q5NBU5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo39Q5NBU5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fbxo39Q5NBU5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fbxo39Q5NBU5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Fbxo39Q5NBU5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fbxo39Q5NBU5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fbxo39Q5NBU5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fbxo39Q5NBU5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms