Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trpm3Q5F4S9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trpm3Q5F4S9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Trpm3Q5F4S9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trpm3Q5F4S9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trpm3Q5F4S9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trpm3Q5F4S9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trpm3Q5F4S9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trpm3Q5F4S9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trpm3Q5F4S9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trpm3Q5F4S9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trpm3Q5F4S9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trpm3Q5F4S9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpm3Q5F4S9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpm3Q5F4S9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpm3Q5F4S9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpm3Q5F4S9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpm3Q5F4S9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpm3Q5F4S9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpm3Q5F4S9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trpm3Q5F4S9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trpm3Q5F4S9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trpm3Q5F4S9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 266 ms