Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG6

Hspb6, Heat shock protein beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspb6Q5EBG6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hspb6Q5EBG6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hspb6Q5EBG6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hspb6Q5EBG6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hspb6Q5EBG6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hspb6Q5EBG6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hspb6Q5EBG6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hspb6Q5EBG6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hspb6Q5EBG6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hspb6Q5EBG6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hspb6Q5EBG6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hspb6Q5EBG6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hspb6Q5EBG6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hspb6Q5EBG6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hspb6Q5EBG6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hspb6Q5EBG6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hspb6Q5EBG6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hspb6Q5EBG6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hspb6Q5EBG6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hspb6Q5EBG6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hspb6Q5EBG6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hspb6Q5EBG6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hspb6Q5EBG6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hspb6Q5EBG6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hspb6Q5EBG6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hspb6Q5EBG6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hspb6Q5EBG6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hspb6Q5EBG6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hspb6Q5EBG6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hspb6Q5EBG6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hspb6Q5EBG6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hspb6Q5EBG6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hspb6Q5EBG6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hspb6Q5EBG6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hspb6Q5EBG6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hspb6Q5EBG6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Hspb6Q5EBG6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hspb6Q5EBG6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.4 ms