Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
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Rtl5Q5DTT4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rtl5Q5DTT4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
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Rtl5Q5DTT4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rtl5Q5DTT4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rtl5Q5DTT4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rtl5Q5DTT4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rtl5Q5DTT4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rtl5Q5DTT4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rtl5Q5DTT4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rtl5Q5DTT4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rtl5Q5DTT4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rtl5Q5DTT4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rtl5Q5DTT4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Rtl5Q5DTT4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rtl5Q5DTT4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
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