Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ESCO2Q56NI9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ESCO2Q56NI9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ESCO2Q56NI9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ESCO2Q56NI9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ESCO2Q56NI9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ESCO2Q56NI9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ESCO2Q56NI9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ESCO2Q56NI9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ESCO2Q56NI9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ESCO2Q56NI9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ESCO2Q56NI9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ESCO2Q56NI9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ESCO2Q56NI9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ESCO2Q56NI9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ESCO2Q56NI9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ESCO2Q56NI9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ESCO2Q56NI9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ESCO2Q56NI9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ESCO2Q56NI9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ESCO2Q56NI9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ESCO2Q56NI9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ESCO2Q56NI9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ESCO2Q56NI9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ESCO2Q56NI9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ESCO2Q56NI9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ESCO2Q56NI9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ESCO2Q56NI9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ESCO2Q56NI9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ESCO2Q56NI9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ESCO2Q56NI9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ESCO2Q56NI9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ESCO2Q56NI9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ESCO2Q56NI9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ESCO2Q56NI9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ESCO2Q56NI9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ESCO2Q56NI9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ESCO2Q56NI9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ESCO2Q56NI9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ESCO2Q56NI9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ESCO2Q56NI9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ESCO2Q56NI9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms