Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tmtc2Q56A06 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmtc2Q56A06 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms