Protein–RNA interactions for Protein: Q52KI8

Srrm1, Serine/arginine repetitive matrix protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm1Q52KI8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srrm1Q52KI8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srrm1Q52KI8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms