Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC38Q502W7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms