Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KHDC1Q4VXA5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KHDC1Q4VXA5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms