Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc3lQ4KL14 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc3lQ4KL14 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc3lQ4KL14 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc3lQ4KL14 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc3lQ4KL14 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc3lQ4KL14 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc3lQ4KL14 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc3lQ4KL14 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc3lQ4KL14 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc3lQ4KL14 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc3lQ4KL14 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc3lQ4KL14 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc3lQ4KL14 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc3lQ4KL14 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc3lQ4KL14 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc3lQ4KL14 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc3lQ4KL14 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc3lQ4KL14 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc3lQ4KL14 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc3lQ4KL14 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc3lQ4KL14 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc3lQ4KL14 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc3lQ4KL14 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc3lQ4KL14 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc3lQ4KL14 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trappc3lQ4KL14 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms