Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Shank3Q4ACU6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Shank3Q4ACU6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Shank3Q4ACU6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Shank3Q4ACU6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms