Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxn3Q499D0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxn3Q499D0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 247.8 ms