Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smim26Q3V460 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim26Q3V460 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim26Q3V460 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim26Q3V460 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim26Q3V460 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim26Q3V460 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim26Q3V460 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim26Q3V460 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim26Q3V460 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim26Q3V460 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim26Q3V460 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim26Q3V460 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim26Q3V460 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim26Q3V460 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim26Q3V460 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim26Q3V460 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim26Q3V460 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim26Q3V460 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim26Q3V460 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim26Q3V460 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim26Q3V460 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim26Q3V460 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim26Q3V460 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim26Q3V460 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim26Q3V460 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim26Q3V460 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim26Q3V460 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smim26Q3V460 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim26Q3V460 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim26Q3V460 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.4 ms