Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkain3Q3URJ8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms